Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME3Q13232 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME3Q13232 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME3Q13232 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME3Q13232 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NME3Q13232 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME3Q13232 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NME3Q13232 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME3Q13232 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME3Q13232 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME3Q13232 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NME3Q13232 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME3Q13232 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME3Q13232 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME3Q13232 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME3Q13232 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME3Q13232 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME3Q13232 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME3Q13232 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME3Q13232 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME3Q13232 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME3Q13232 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NME3Q13232 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NME3Q13232 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NME3Q13232 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME3Q13232 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME3Q13232 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NME3Q13232 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME3Q13232 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME3Q13232 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NME3Q13232 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NME3Q13232 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NME3Q13232 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME3Q13232 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME3Q13232 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME3Q13232 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME3Q13232 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME3Q13232 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME3Q13232 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NME3Q13232 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME3Q13232 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME3Q13232 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NME3Q13232 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME3Q13232 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME3Q13232 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NME3Q13232 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME3Q13232 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NME3Q13232 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME3Q13232 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME3Q13232 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NME3Q13232 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NME3Q13232 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NME3Q13232 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME3Q13232 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME3Q13232 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME3Q13232 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME3Q13232 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME3Q13232 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME3Q13232 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NME3Q13232 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NME3Q13232 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NME3Q13232 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NME3Q13232 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME3Q13232 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NME3Q13232 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME3Q13232 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME3Q13232 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME3Q13232 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NME3Q13232 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NME3Q13232 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME3Q13232 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME3Q13232 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME3Q13232 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NME3Q13232 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NME3Q13232 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME3Q13232 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME3Q13232 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NME3Q13232 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NME3Q13232 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME3Q13232 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NME3Q13232 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NME3Q13232 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NME3Q13232 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NME3Q13232 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NME3Q13232 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NME3Q13232 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NME3Q13232 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME3Q13232 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NME3Q13232 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME3Q13232 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME3Q13232 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME3Q13232 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME3Q13232 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME3Q13232 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME3Q13232 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NME3Q13232 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME3Q13232 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME3Q13232 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NME3Q13232 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME3Q13232 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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