Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCRN3Q0VDG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCRN3Q0VDG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCRN3Q0VDG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCRN3Q0VDG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCRN3Q0VDG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms