Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSC1Q08554 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DSC1Q08554 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSC1Q08554 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DSC1Q08554 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DSC1Q08554 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DSC1Q08554 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSC1Q08554 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms