Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF4Q08170 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRSF4Q08170 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF4Q08170 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRSF4Q08170 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRSF4Q08170 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRSF4Q08170 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms