Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNP2Q05952 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNP2Q05952 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNP2Q05952 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNP2Q05952 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNP2Q05952 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms