Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SATB1Q01826 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SATB1Q01826 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SATB1Q01826 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SATB1Q01826 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SATB1Q01826 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SATB1Q01826 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SATB1Q01826 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SATB1Q01826 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SATB1Q01826 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SATB1Q01826 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SATB1Q01826 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SATB1Q01826 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SATB1Q01826 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SATB1Q01826 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SATB1Q01826 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SATB1Q01826 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SATB1Q01826 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SATB1Q01826 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SATB1Q01826 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SATB1Q01826 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SATB1Q01826 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SATB1Q01826 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms