Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFA5Q01523 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEFA5Q01523 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEFA5Q01523 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEFA5Q01523 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DEFA5Q01523 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DEFA5Q01523 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DEFA5Q01523 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA5Q01523 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DEFA5Q01523 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms