Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSNK2A1P68400 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSNK2A1P68400 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSNK2A1P68400 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSNK2A1P68400 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CSNK2A1P68400 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK2A1P68400 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms