Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBB4BP68371 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBB4BP68371 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBB4BP68371 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB4BP68371 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB4BP68371 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB4BP68371 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms