Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2NP61088 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NP61088 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NP61088 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2NP61088 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2NP61088 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2NP61088 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms