Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCCD1P59942 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCCD1P59942 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCD1P59942 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCD1P59942 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCCD1P59942 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MCCD1P59942 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MCCD1P59942 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MCCD1P59942 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MCCD1P59942 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCCD1P59942 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCCD1P59942 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms