Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RTP1P59025 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RTP1P59025 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RTP1P59025 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RTP1P59025 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTP1P59025 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTP1P59025 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTP1P59025 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTP1P59025 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTP1P59025 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTP1P59025 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RTP1P59025 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTP1P59025 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RTP1P59025 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RTP1P59025 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTP1P59025 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTP1P59025 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RTP1P59025 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTP1P59025 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTP1P59025 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTP1P59025 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTP1P59025 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTP1P59025 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTP1P59025 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTP1P59025 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RTP1P59025 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RTP1P59025 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTP1P59025 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTP1P59025 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTP1P59025 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTP1P59025 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RTP1P59025 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTP1P59025 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTP1P59025 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTP1P59025 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTP1P59025 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTP1P59025 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTP1P59025 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTP1P59025 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTP1P59025 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTP1P59025 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTP1P59025 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTP1P59025 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTP1P59025 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RTP1P59025 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTP1P59025 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTP1P59025 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTP1P59025 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RTP1P59025 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RTP1P59025 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTP1P59025 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTP1P59025 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTP1P59025 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTP1P59025 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RTP1P59025 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RTP1P59025 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RTP1P59025 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTP1P59025 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RTP1P59025 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTP1P59025 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTP1P59025 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTP1P59025 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTP1P59025 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTP1P59025 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTP1P59025 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTP1P59025 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RTP1P59025 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTP1P59025 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RTP1P59025 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTP1P59025 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTP1P59025 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTP1P59025 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTP1P59025 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTP1P59025 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTP1P59025 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTP1P59025 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTP1P59025 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTP1P59025 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RTP1P59025 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTP1P59025 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTP1P59025 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTP1P59025 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTP1P59025 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTP1P59025 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTP1P59025 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RTP1P59025 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTP1P59025 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTP1P59025 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTP1P59025 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTP1P59025 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTP1P59025 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTP1P59025 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTP1P59025 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTP1P59025 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTP1P59025 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTP1P59025 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTP1P59025 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTP1P59025 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTP1P59025 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTP1P59025 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms