Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP107P57740 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP107P57740 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP107P57740 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP107P57740 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP107P57740 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP107P57740 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP107P57740 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP107P57740 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP107P57740 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP107P57740 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP107P57740 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP107P57740 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP107P57740 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP107P57740 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP107P57740 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP107P57740 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP107P57740 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP107P57740 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP107P57740 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP107P57740 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP107P57740 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP107P57740 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP107P57740 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP107P57740 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP107P57740 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP107P57740 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP107P57740 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP107P57740 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP107P57740 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP107P57740 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP107P57740 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP107P57740 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP107P57740 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP107P57740 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP107P57740 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP107P57740 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP107P57740 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP107P57740 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP107P57740 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP107P57740 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP107P57740 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP107P57740 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP107P57740 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP107P57740 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP107P57740 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP107P57740 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP107P57740 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP107P57740 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP107P57740 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP107P57740 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP107P57740 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP107P57740 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP107P57740 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP107P57740 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP107P57740 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP107P57740 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP107P57740 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP107P57740 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP107P57740 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP107P57740 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP107P57740 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP107P57740 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP107P57740 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP107P57740 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP107P57740 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP107P57740 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP107P57740 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP107P57740 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP107P57740 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP107P57740 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP107P57740 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP107P57740 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP107P57740 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP107P57740 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP107P57740 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP107P57740 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP107P57740 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP107P57740 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP107P57740 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP107P57740 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP107P57740 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP107P57740 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP107P57740 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP107P57740 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP107P57740 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP107P57740 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP107P57740 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP107P57740 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP107P57740 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP107P57740 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP107P57740 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP107P57740 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP107P57740 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP107P57740 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP107P57740 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP107P57740 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP107P57740 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP107P57740 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP107P57740 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms