Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGALS4P56470 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LGALS4P56470 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGALS4P56470 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LGALS4P56470 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms