Protein–RNA interactions for Protein: P56385

ATP5I, ATP synthase subunit e, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5IP56385 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5IP56385 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5IP56385 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5IP56385 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5IP56385 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP5IP56385 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP5IP56385 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5IP56385 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms