Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUMO3P55854 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUMO3P55854 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUMO3P55854 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUMO3P55854 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUMO3P55854 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUMO3P55854 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUMO3P55854 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms