Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
AFDNP55196 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
AFDNP55196 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
AFDNP55196 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
AFDNP55196 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
AFDNP55196 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
AFDNP55196 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AFDNP55196 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AFDNP55196 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AFDNP55196 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
AFDNP55196 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
AFDNP55196 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
AFDNP55196 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
AFDNP55196 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
AFDNP55196 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
AFDNP55196 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
AFDNP55196 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
AFDNP55196 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
AFDNP55196 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
AFDNP55196 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
AFDNP55196 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
AFDNP55196 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
AFDNP55196 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
AFDNP55196 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
AFDNP55196 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
AFDNP55196 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
AFDNP55196 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
AFDNP55196 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
AFDNP55196 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
AFDNP55196 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
AFDNP55196 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
AFDNP55196 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
AFDNP55196 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
AFDNP55196 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
AFDNP55196 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
AFDNP55196 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
AFDNP55196 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
AFDNP55196 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
AFDNP55196 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
AFDNP55196 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
AFDNP55196 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
AFDNP55196 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
AFDNP55196 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
AFDNP55196 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
AFDNP55196 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
AFDNP55196 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
AFDNP55196 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
AFDNP55196 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
AFDNP55196 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
AFDNP55196 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
AFDNP55196 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
AFDNP55196 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
AFDNP55196 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
AFDNP55196 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
AFDNP55196 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
AFDNP55196 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
AFDNP55196 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34■■■■□ 3.03
AFDNP55196 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
AFDNP55196 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
AFDNP55196 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
AFDNP55196 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
AFDNP55196 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
AFDNP55196 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
AFDNP55196 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
AFDNP55196 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
AFDNP55196 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
AFDNP55196 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
AFDNP55196 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
AFDNP55196 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
AFDNP55196 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
AFDNP55196 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
AFDNP55196 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
AFDNP55196 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
AFDNP55196 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
AFDNP55196 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AFDNP55196 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AFDNP55196 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
AFDNP55196 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
AFDNP55196 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
AFDNP55196 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
AFDNP55196 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
AFDNP55196 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
AFDNP55196 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
AFDNP55196 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AFDNP55196 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
AFDNP55196 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
AFDNP55196 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
AFDNP55196 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
AFDNP55196 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
AFDNP55196 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AFDNP55196 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AFDNP55196 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
AFDNP55196 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AFDNP55196 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AFDNP55196 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AFDNP55196 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
AFDNP55196 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AFDNP55196 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
AFDNP55196 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AFDNP55196 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms