Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MFAP3P55082 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MFAP3P55082 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MFAP3P55082 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MFAP3P55082 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MFAP3P55082 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MFAP3P55082 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms