Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATXN1P54253 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATXN1P54253 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATXN1P54253 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN1P54253 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN1P54253 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms