Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF140P52738 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF140P52738 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF140P52738 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF140P52738 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF140P52738 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF140P52738 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF140P52738 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms