Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RND2P52198 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RND2P52198 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND2P52198 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND2P52198 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND2P52198 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND2P52198 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND2P52198 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND2P52198 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RND2P52198 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RND2P52198 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RND2P52198 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND2P52198 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND2P52198 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND2P52198 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND2P52198 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND2P52198 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND2P52198 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND2P52198 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND2P52198 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND2P52198 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RND2P52198 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RND2P52198 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RND2P52198 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RND2P52198 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RND2P52198 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RND2P52198 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RND2P52198 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RND2P52198 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RND2P52198 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RND2P52198 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RND2P52198 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RND2P52198 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RND2P52198 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RND2P52198 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RND2P52198 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RND2P52198 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RND2P52198 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RND2P52198 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RND2P52198 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RND2P52198 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RND2P52198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RND2P52198 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RND2P52198 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RND2P52198 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RND2P52198 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RND2P52198 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RND2P52198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RND2P52198 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RND2P52198 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RND2P52198 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RND2P52198 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RND2P52198 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RND2P52198 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RND2P52198 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RND2P52198 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RND2P52198 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RND2P52198 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RND2P52198 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RND2P52198 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RND2P52198 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RND2P52198 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RND2P52198 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RND2P52198 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RND2P52198 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RND2P52198 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RND2P52198 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RND2P52198 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RND2P52198 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RND2P52198 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RND2P52198 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RND2P52198 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RND2P52198 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RND2P52198 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RND2P52198 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RND2P52198 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RND2P52198 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RND2P52198 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RND2P52198 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RND2P52198 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RND2P52198 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RND2P52198 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RND2P52198 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RND2P52198 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RND2P52198 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RND2P52198 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RND2P52198 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RND2P52198 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RND2P52198 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RND2P52198 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RND2P52198 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RND2P52198 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RND2P52198 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RND2P52198 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RND2P52198 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RND2P52198 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RND2P52198 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RND2P52198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RND2P52198 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RND2P52198 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms