Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSEN1P49768 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSEN1P49768 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSEN1P49768 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSEN1P49768 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSEN1P49768 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSEN1P49768 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms