Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2AP49459 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2AP49459 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2AP49459 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2AP49459 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2AP49459 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms