Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUFMP49411 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUFMP49411 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUFMP49411 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUFMP49411 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUFMP49411 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUFMP49411 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUFMP49411 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUFMP49411 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUFMP49411 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUFMP49411 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUFMP49411 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TUFMP49411 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUFMP49411 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TUFMP49411 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUFMP49411 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUFMP49411 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUFMP49411 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUFMP49411 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUFMP49411 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUFMP49411 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUFMP49411 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUFMP49411 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUFMP49411 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TUFMP49411 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUFMP49411 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUFMP49411 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUFMP49411 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUFMP49411 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUFMP49411 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUFMP49411 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TUFMP49411 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUFMP49411 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUFMP49411 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUFMP49411 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUFMP49411 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUFMP49411 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUFMP49411 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TUFMP49411 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUFMP49411 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUFMP49411 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUFMP49411 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUFMP49411 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUFMP49411 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUFMP49411 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUFMP49411 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUFMP49411 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUFMP49411 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TUFMP49411 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUFMP49411 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUFMP49411 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUFMP49411 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUFMP49411 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUFMP49411 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUFMP49411 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TUFMP49411 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUFMP49411 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUFMP49411 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TUFMP49411 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUFMP49411 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUFMP49411 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUFMP49411 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFMP49411 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFMP49411 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFMP49411 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFMP49411 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFMP49411 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUFMP49411 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUFMP49411 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUFMP49411 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUFMP49411 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFMP49411 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFMP49411 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUFMP49411 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUFMP49411 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFMP49411 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFMP49411 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFMP49411 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFMP49411 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFMP49411 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFMP49411 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFMP49411 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFMP49411 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFMP49411 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFMP49411 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFMP49411 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFMP49411 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFMP49411 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFMP49411 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFMP49411 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUFMP49411 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUFMP49411 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUFMP49411 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUFMP49411 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFMP49411 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFMP49411 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFMP49411 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFMP49411 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUFMP49411 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUFMP49411 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms