Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMAN1P49257 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMAN1P49257 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMAN1P49257 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMAN1P49257 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMAN1P49257 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMAN1P49257 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMAN1P49257 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMAN1P49257 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMAN1P49257 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMAN1P49257 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMAN1P49257 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms