Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSSP48449 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSSP48449 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSSP48449 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSSP48449 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSSP48449 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSSP48449 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSSP48449 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSSP48449 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSSP48449 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSSP48449 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSSP48449 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSSP48449 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LSSP48449 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSSP48449 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSSP48449 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSSP48449 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSSP48449 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSSP48449 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSSP48449 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSSP48449 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSSP48449 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSSP48449 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSSP48449 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSSP48449 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSSP48449 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSSP48449 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSSP48449 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSSP48449 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSSP48449 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LSSP48449 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSSP48449 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSSP48449 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSSP48449 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSSP48449 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSSP48449 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSSP48449 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSSP48449 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSSP48449 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LSSP48449 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSSP48449 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LSSP48449 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSSP48449 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSSP48449 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSSP48449 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSSP48449 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSSP48449 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSSP48449 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSSP48449 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSSP48449 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSSP48449 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSSP48449 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSSP48449 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSSP48449 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSSP48449 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSSP48449 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSSP48449 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSSP48449 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSSP48449 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSSP48449 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSSP48449 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSSP48449 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSSP48449 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSSP48449 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSSP48449 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSSP48449 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LSSP48449 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSSP48449 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSSP48449 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSSP48449 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSSP48449 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSSP48449 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSSP48449 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSSP48449 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LSSP48449 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSSP48449 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LSSP48449 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSSP48449 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LSSP48449 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSSP48449 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSSP48449 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSSP48449 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSSP48449 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSSP48449 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSSP48449 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LSSP48449 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSSP48449 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LSSP48449 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LSSP48449 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSSP48449 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSSP48449 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSSP48449 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSSP48449 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LSSP48449 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSSP48449 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSSP48449 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSSP48449 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSSP48449 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSSP48449 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSSP48449 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms