Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HALP42357 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HALP42357 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HALP42357 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HALP42357 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HALP42357 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HALP42357 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HALP42357 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HALP42357 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HALP42357 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HALP42357 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HALP42357 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HALP42357 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HALP42357 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HALP42357 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HALP42357 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HALP42357 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HALP42357 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HALP42357 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HALP42357 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HALP42357 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HALP42357 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HALP42357 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HALP42357 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HALP42357 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HALP42357 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HALP42357 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HALP42357 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HALP42357 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HALP42357 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HALP42357 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HALP42357 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HALP42357 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HALP42357 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HALP42357 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HALP42357 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HALP42357 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HALP42357 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HALP42357 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HALP42357 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HALP42357 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HALP42357 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HALP42357 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HALP42357 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HALP42357 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HALP42357 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HALP42357 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HALP42357 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HALP42357 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HALP42357 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HALP42357 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HALP42357 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HALP42357 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HALP42357 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HALP42357 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HALP42357 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HALP42357 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HALP42357 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HALP42357 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HALP42357 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HALP42357 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HALP42357 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HALP42357 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HALP42357 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HALP42357 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HALP42357 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HALP42357 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HALP42357 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HALP42357 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HALP42357 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HALP42357 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HALP42357 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HALP42357 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HALP42357 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HALP42357 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HALP42357 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HALP42357 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HALP42357 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HALP42357 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HALP42357 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HALP42357 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HALP42357 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HALP42357 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HALP42357 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HALP42357 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HALP42357 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HALP42357 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HALP42357 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HALP42357 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HALP42357 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HALP42357 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HALP42357 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HALP42357 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms