Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HSPA9P38646 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HSPA9P38646 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HSPA9P38646 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSPA9P38646 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSPA9P38646 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HSPA9P38646 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA9P38646 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA9P38646 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HSPA9P38646 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA9P38646 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA9P38646 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA9P38646 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HSPA9P38646 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HSPA9P38646 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA9P38646 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HSPA9P38646 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA9P38646 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HSPA9P38646 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HSPA9P38646 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA9P38646 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA9P38646 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA9P38646 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA9P38646 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HSPA9P38646 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HSPA9P38646 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HSPA9P38646 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms