Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRH1P35367 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRH1P35367 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HRH1P35367 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRH1P35367 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRH1P35367 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRH1P35367 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HRH1P35367 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HRH1P35367 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HRH1P35367 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HRH1P35367 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HRH1P35367 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HRH1P35367 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRH1P35367 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRH1P35367 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRH1P35367 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HRH1P35367 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRH1P35367 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRH1P35367 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRH1P35367 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRH1P35367 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HRH1P35367 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HRH1P35367 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HRH1P35367 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRH1P35367 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRH1P35367 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRH1P35367 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HRH1P35367 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRH1P35367 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRH1P35367 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRH1P35367 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRH1P35367 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRH1P35367 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRH1P35367 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRH1P35367 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRH1P35367 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRH1P35367 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRH1P35367 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRH1P35367 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRH1P35367 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRH1P35367 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRH1P35367 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HRH1P35367 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HRH1P35367 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRH1P35367 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRH1P35367 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRH1P35367 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HRH1P35367 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HRH1P35367 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRH1P35367 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HRH1P35367 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRH1P35367 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRH1P35367 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRH1P35367 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HRH1P35367 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRH1P35367 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HRH1P35367 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRH1P35367 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HRH1P35367 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRH1P35367 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRH1P35367 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRH1P35367 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRH1P35367 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HRH1P35367 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRH1P35367 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HRH1P35367 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HRH1P35367 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HRH1P35367 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HRH1P35367 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HRH1P35367 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRH1P35367 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRH1P35367 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HRH1P35367 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRH1P35367 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HRH1P35367 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRH1P35367 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HRH1P35367 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HRH1P35367 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HRH1P35367 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRH1P35367 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HRH1P35367 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRH1P35367 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HRH1P35367 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HRH1P35367 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HRH1P35367 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HRH1P35367 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HRH1P35367 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HRH1P35367 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HRH1P35367 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRH1P35367 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HRH1P35367 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HRH1P35367 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HRH1P35367 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms