Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPDP35247 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPDP35247 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPDP35247 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFTPDP35247 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPDP35247 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPDP35247 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms