Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGER1P34995 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGER1P34995 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGER1P34995 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGER1P34995 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER1P34995 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGER1P34995 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms