Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RYKP34925 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYKP34925 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RYKP34925 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RYKP34925 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYKP34925 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYKP34925 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RYKP34925 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYKP34925 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RYKP34925 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYKP34925 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RYKP34925 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RYKP34925 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RYKP34925 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYKP34925 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RYKP34925 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RYKP34925 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYKP34925 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYKP34925 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RYKP34925 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RYKP34925 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RYKP34925 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYKP34925 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RYKP34925 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYKP34925 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYKP34925 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYKP34925 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYKP34925 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RYKP34925 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RYKP34925 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYKP34925 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYKP34925 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RYKP34925 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYKP34925 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RYKP34925 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYKP34925 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RYKP34925 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYKP34925 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYKP34925 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RYKP34925 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYKP34925 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYKP34925 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYKP34925 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RYKP34925 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RYKP34925 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RYKP34925 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RYKP34925 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYKP34925 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RYKP34925 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYKP34925 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYKP34925 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYKP34925 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYKP34925 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RYKP34925 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RYKP34925 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RYKP34925 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RYKP34925 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RYKP34925 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RYKP34925 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RYKP34925 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RYKP34925 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RYKP34925 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYKP34925 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYKP34925 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYKP34925 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RYKP34925 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYKP34925 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RYKP34925 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYKP34925 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYKP34925 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYKP34925 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYKP34925 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RYKP34925 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYKP34925 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYKP34925 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYKP34925 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RYKP34925 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RYKP34925 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RYKP34925 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RYKP34925 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RYKP34925 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYKP34925 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYKP34925 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RYKP34925 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RYKP34925 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RYKP34925 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RYKP34925 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYKP34925 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYKP34925 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RYKP34925 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYKP34925 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYKP34925 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RYKP34925 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RYKP34925 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYKP34925 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYKP34925 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RYKP34925 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RYKP34925 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RYKP34925 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RYKP34925 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms