Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC12P31275 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC12P31275 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXC12P31275 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC12P31275 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms