Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPL13P26373 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPL13P26373 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPL13P26373 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPL13P26373 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPL13P26373 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RPL13P26373 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPL13P26373 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPL13P26373 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPL13P26373 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPL13P26373 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPL13P26373 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPL13P26373 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPL13P26373 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RPL13P26373 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPL13P26373 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPL13P26373 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RPL13P26373 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPL13P26373 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPL13P26373 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPL13P26373 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPL13P26373 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPL13P26373 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPL13P26373 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPL13P26373 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPL13P26373 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPL13P26373 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPL13P26373 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPL13P26373 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPL13P26373 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPL13P26373 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPL13P26373 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPL13P26373 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPL13P26373 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPL13P26373 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPL13P26373 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPL13P26373 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPL13P26373 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPL13P26373 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPL13P26373 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPL13P26373 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPL13P26373 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPL13P26373 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPL13P26373 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPL13P26373 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPL13P26373 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPL13P26373 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPL13P26373 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPL13P26373 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RPL13P26373 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPL13P26373 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL13P26373 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL13P26373 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL13P26373 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPL13P26373 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPL13P26373 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPL13P26373 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPL13P26373 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPL13P26373 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPL13P26373 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPL13P26373 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPL13P26373 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPL13P26373 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPL13P26373 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPL13P26373 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPL13P26373 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPL13P26373 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPL13P26373 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPL13P26373 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPL13P26373 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPL13P26373 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPL13P26373 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPL13P26373 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPL13P26373 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPL13P26373 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPL13P26373 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPL13P26373 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPL13P26373 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPL13P26373 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPL13P26373 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RPL13P26373 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPL13P26373 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPL13P26373 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPL13P26373 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPL13P26373 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RPL13P26373 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL13P26373 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL13P26373 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPL13P26373 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPL13P26373 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL13P26373 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL13P26373 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPL13P26373 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPL13P26373 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPL13P26373 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL13P26373 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL13P26373 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL13P26373 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL13P26373 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPL13P26373 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms