Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DNMT1P26358 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DNMT1P26358 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DNMT1P26358 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DNMT1P26358 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
DNMT1P26358 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
DNMT1P26358 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DNMT1P26358 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
DNMT1P26358 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
DNMT1P26358 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
DNMT1P26358 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
DNMT1P26358 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.61■■■■■ 4.09
DNMT1P26358 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
DNMT1P26358 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
DNMT1P26358 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
DNMT1P26358 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
DNMT1P26358 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.55■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
DNMT1P26358 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
DNMT1P26358 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
DNMT1P26358 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
DNMT1P26358 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
DNMT1P26358 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
DNMT1P26358 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
DNMT1P26358 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms