Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFKBIAP25963 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIAP25963 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIAP25963 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFKBIAP25963 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIAP25963 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms