Protein–RNA interactions for Protein: P24311

COX7B, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7BP24311 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COX7BP24311 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COX7BP24311 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COX7BP24311 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COX7BP24311 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COX7BP24311 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COX7BP24311 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COX7BP24311 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COX7BP24311 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COX7BP24311 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COX7BP24311 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COX7BP24311 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COX7BP24311 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COX7BP24311 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COX7BP24311 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COX7BP24311 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COX7BP24311 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COX7BP24311 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COX7BP24311 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COX7BP24311 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COX7BP24311 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COX7BP24311 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COX7BP24311 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COX7BP24311 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COX7BP24311 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COX7BP24311 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COX7BP24311 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COX7BP24311 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COX7BP24311 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COX7BP24311 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COX7BP24311 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COX7BP24311 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COX7BP24311 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COX7BP24311 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COX7BP24311 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COX7BP24311 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COX7BP24311 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COX7BP24311 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COX7BP24311 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COX7BP24311 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COX7BP24311 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COX7BP24311 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COX7BP24311 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COX7BP24311 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COX7BP24311 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COX7BP24311 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COX7BP24311 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COX7BP24311 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COX7BP24311 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COX7BP24311 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COX7BP24311 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COX7BP24311 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COX7BP24311 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COX7BP24311 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COX7BP24311 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COX7BP24311 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COX7BP24311 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COX7BP24311 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COX7BP24311 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COX7BP24311 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COX7BP24311 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COX7BP24311 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX7BP24311 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX7BP24311 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX7BP24311 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX7BP24311 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COX7BP24311 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX7BP24311 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX7BP24311 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COX7BP24311 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX7BP24311 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX7BP24311 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX7BP24311 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX7BP24311 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COX7BP24311 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX7BP24311 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COX7BP24311 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX7BP24311 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX7BP24311 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX7BP24311 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX7BP24311 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COX7BP24311 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX7BP24311 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COX7BP24311 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX7BP24311 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX7BP24311 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COX7BP24311 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX7BP24311 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COX7BP24311 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX7BP24311 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX7BP24311 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX7BP24311 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX7BP24311 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX7BP24311 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX7BP24311 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX7BP24311 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX7BP24311 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX7BP24311 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX7BP24311 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX7BP24311 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms