Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD58P19256 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD58P19256 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD58P19256 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD58P19256 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD58P19256 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD58P19256 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD58P19256 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD58P19256 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD58P19256 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD58P19256 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD58P19256 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD58P19256 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD58P19256 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD58P19256 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD58P19256 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CD58P19256 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD58P19256 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD58P19256 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD58P19256 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD58P19256 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD58P19256 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD58P19256 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD58P19256 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD58P19256 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CD58P19256 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD58P19256 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD58P19256 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD58P19256 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD58P19256 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD58P19256 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD58P19256 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD58P19256 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD58P19256 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD58P19256 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD58P19256 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD58P19256 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD58P19256 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD58P19256 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD58P19256 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD58P19256 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD58P19256 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD58P19256 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD58P19256 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD58P19256 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD58P19256 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD58P19256 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD58P19256 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CD58P19256 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD58P19256 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD58P19256 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD58P19256 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD58P19256 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CD58P19256 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD58P19256 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD58P19256 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD58P19256 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD58P19256 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD58P19256 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD58P19256 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD58P19256 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD58P19256 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD58P19256 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CD58P19256 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD58P19256 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD58P19256 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD58P19256 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CD58P19256 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD58P19256 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD58P19256 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CD58P19256 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CD58P19256 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD58P19256 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD58P19256 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CD58P19256 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD58P19256 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD58P19256 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD58P19256 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD58P19256 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD58P19256 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD58P19256 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD58P19256 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD58P19256 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD58P19256 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD58P19256 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD58P19256 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD58P19256 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD58P19256 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CD58P19256 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD58P19256 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CD58P19256 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD58P19256 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD58P19256 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD58P19256 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD58P19256 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD58P19256 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD58P19256 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD58P19256 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD58P19256 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CD58P19256 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms