Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXB3P14651 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXB3P14651 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXB3P14651 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXB3P14651 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXB3P14651 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXB3P14651 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms