Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYL1P12980 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYL1P12980 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYL1P12980 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYL1P12980 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYL1P12980 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYL1P12980 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYL1P12980 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYL1P12980 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYL1P12980 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYL1P12980 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYL1P12980 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYL1P12980 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYL1P12980 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYL1P12980 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LYL1P12980 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYL1P12980 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYL1P12980 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYL1P12980 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYL1P12980 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYL1P12980 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYL1P12980 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYL1P12980 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYL1P12980 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYL1P12980 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYL1P12980 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYL1P12980 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYL1P12980 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYL1P12980 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYL1P12980 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYL1P12980 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYL1P12980 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYL1P12980 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYL1P12980 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYL1P12980 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYL1P12980 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LYL1P12980 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYL1P12980 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYL1P12980 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYL1P12980 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYL1P12980 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYL1P12980 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYL1P12980 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYL1P12980 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYL1P12980 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYL1P12980 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LYL1P12980 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYL1P12980 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYL1P12980 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYL1P12980 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYL1P12980 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYL1P12980 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYL1P12980 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYL1P12980 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYL1P12980 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYL1P12980 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYL1P12980 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYL1P12980 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYL1P12980 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYL1P12980 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYL1P12980 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYL1P12980 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYL1P12980 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYL1P12980 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYL1P12980 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYL1P12980 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LYL1P12980 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYL1P12980 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYL1P12980 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYL1P12980 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYL1P12980 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYL1P12980 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYL1P12980 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYL1P12980 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYL1P12980 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYL1P12980 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYL1P12980 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LYL1P12980 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYL1P12980 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYL1P12980 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYL1P12980 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYL1P12980 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LYL1P12980 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LYL1P12980 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYL1P12980 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYL1P12980 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYL1P12980 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYL1P12980 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYL1P12980 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYL1P12980 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYL1P12980 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYL1P12980 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYL1P12980 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYL1P12980 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYL1P12980 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYL1P12980 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYL1P12980 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYL1P12980 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYL1P12980 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYL1P12980 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms