Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAMP11215 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAMP11215 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAMP11215 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAMP11215 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAMP11215 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGAMP11215 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGAMP11215 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms