Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Z0

H2AFB2, Histone H2A-Bbd type 2/3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB2P0C5Z0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFB2P0C5Z0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFB2P0C5Z0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2AFB2P0C5Z0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFB2P0C5Z0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFB2P0C5Z0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H2AFB2P0C5Z0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFB2P0C5Z0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2AFB2P0C5Z0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms