Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROS1P08922 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROS1P08922 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROS1P08922 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ROS1P08922 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROS1P08922 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROS1P08922 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROS1P08922 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROS1P08922 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROS1P08922 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROS1P08922 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROS1P08922 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROS1P08922 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROS1P08922 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROS1P08922 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROS1P08922 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROS1P08922 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROS1P08922 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ROS1P08922 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ROS1P08922 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROS1P08922 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROS1P08922 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROS1P08922 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROS1P08922 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROS1P08922 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROS1P08922 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROS1P08922 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROS1P08922 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROS1P08922 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROS1P08922 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROS1P08922 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROS1P08922 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROS1P08922 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ROS1P08922 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ROS1P08922 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROS1P08922 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROS1P08922 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ROS1P08922 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROS1P08922 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROS1P08922 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ROS1P08922 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROS1P08922 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROS1P08922 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROS1P08922 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ROS1P08922 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROS1P08922 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROS1P08922 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROS1P08922 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROS1P08922 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROS1P08922 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROS1P08922 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROS1P08922 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROS1P08922 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROS1P08922 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROS1P08922 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ROS1P08922 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROS1P08922 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROS1P08922 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROS1P08922 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROS1P08922 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROS1P08922 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROS1P08922 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROS1P08922 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROS1P08922 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROS1P08922 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROS1P08922 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROS1P08922 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROS1P08922 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ROS1P08922 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ROS1P08922 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROS1P08922 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROS1P08922 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROS1P08922 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROS1P08922 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ROS1P08922 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROS1P08922 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROS1P08922 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROS1P08922 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROS1P08922 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROS1P08922 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROS1P08922 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROS1P08922 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROS1P08922 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROS1P08922 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROS1P08922 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROS1P08922 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROS1P08922 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROS1P08922 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROS1P08922 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ROS1P08922 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROS1P08922 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROS1P08922 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROS1P08922 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROS1P08922 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROS1P08922 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROS1P08922 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROS1P08922 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ROS1P08922 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ROS1P08922 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROS1P08922 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms