Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MMP3P08254 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MMP3P08254 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MMP3P08254 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MMP3P08254 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MMP3P08254 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MMP3P08254 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MMP3P08254 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MMP3P08254 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MMP3P08254 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MMP3P08254 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MMP3P08254 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MMP3P08254 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MMP3P08254 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MMP3P08254 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MMP3P08254 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MMP3P08254 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MMP3P08254 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MMP3P08254 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MMP3P08254 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MMP3P08254 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MMP3P08254 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MMP3P08254 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MMP3P08254 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MMP3P08254 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MMP3P08254 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MMP3P08254 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MMP3P08254 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MMP3P08254 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MMP3P08254 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MMP3P08254 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MMP3P08254 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MMP3P08254 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMP3P08254 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMP3P08254 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMP3P08254 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMP3P08254 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMP3P08254 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMP3P08254 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MMP3P08254 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MMP3P08254 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MMP3P08254 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MMP3P08254 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MMP3P08254 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MMP3P08254 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MMP3P08254 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MMP3P08254 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP3P08254 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP3P08254 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP3P08254 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP3P08254 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP3P08254 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP3P08254 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMP3P08254 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP3P08254 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP3P08254 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP3P08254 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP3P08254 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP3P08254 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP3P08254 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP3P08254 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP3P08254 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP3P08254 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP3P08254 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP3P08254 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP3P08254 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP3P08254 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP3P08254 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP3P08254 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP3P08254 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP3P08254 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP3P08254 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP3P08254 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MMP3P08254 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MMP3P08254 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP3P08254 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP3P08254 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP3P08254 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP3P08254 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP3P08254 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP3P08254 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP3P08254 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP3P08254 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP3P08254 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP3P08254 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP3P08254 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP3P08254 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MMP3P08254 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP3P08254 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP3P08254 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP3P08254 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP3P08254 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MMP3P08254 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MMP3P08254 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MMP3P08254 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP3P08254 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP3P08254 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP3P08254 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP3P08254 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MMP3P08254 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms