Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKMP06732 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKMP06732 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKMP06732 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKMP06732 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CKMP06732 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CKMP06732 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKMP06732 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKMP06732 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKMP06732 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CKMP06732 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKMP06732 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CKMP06732 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKMP06732 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKMP06732 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKMP06732 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKMP06732 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKMP06732 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKMP06732 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CKMP06732 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CKMP06732 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CKMP06732 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CKMP06732 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKMP06732 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKMP06732 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKMP06732 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CKMP06732 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKMP06732 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKMP06732 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKMP06732 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMP06732 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMP06732 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMP06732 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMP06732 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKMP06732 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKMP06732 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CKMP06732 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CKMP06732 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CKMP06732 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CKMP06732 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CKMP06732 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKMP06732 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CKMP06732 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKMP06732 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKMP06732 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKMP06732 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKMP06732 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKMP06732 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKMP06732 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKMP06732 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKMP06732 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKMP06732 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKMP06732 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKMP06732 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKMP06732 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKMP06732 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CKMP06732 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKMP06732 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKMP06732 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKMP06732 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CKMP06732 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CKMP06732 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKMP06732 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKMP06732 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKMP06732 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKMP06732 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CKMP06732 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CKMP06732 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKMP06732 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKMP06732 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKMP06732 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKMP06732 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKMP06732 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKMP06732 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKMP06732 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKMP06732 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKMP06732 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKMP06732 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKMP06732 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKMP06732 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKMP06732 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKMP06732 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CKMP06732 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CKMP06732 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CKMP06732 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CKMP06732 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CKMP06732 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKMP06732 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CKMP06732 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKMP06732 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKMP06732 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CKMP06732 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CKMP06732 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CKMP06732 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKMP06732 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKMP06732 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CKMP06732 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CKMP06732 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CKMP06732 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CKMP06732 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms