Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DQB1P01920 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DQB1P01920 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DQB1P01920 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DQB1P01920 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB1P01920 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB1P01920 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQB1P01920 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms