Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F9P00740 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F9P00740 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
F9P00740 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
F9P00740 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
F9P00740 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
F9P00740 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
F9P00740 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
F9P00740 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F9P00740 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F9P00740 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F9P00740 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F9P00740 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
F9P00740 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F9P00740 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
F9P00740 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
F9P00740 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
F9P00740 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
F9P00740 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F9P00740 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
F9P00740 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
F9P00740 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F9P00740 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F9P00740 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
F9P00740 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
F9P00740 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F9P00740 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F9P00740 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
F9P00740 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F9P00740 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F9P00740 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F9P00740 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F9P00740 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
F9P00740 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F9P00740 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
F9P00740 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F9P00740 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F9P00740 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F9P00740 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F9P00740 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
F9P00740 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
F9P00740 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F9P00740 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
F9P00740 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
F9P00740 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F9P00740 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F9P00740 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
F9P00740 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F9P00740 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
F9P00740 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
F9P00740 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F9P00740 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F9P00740 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F9P00740 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F9P00740 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F9P00740 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F9P00740 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F9P00740 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
F9P00740 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F9P00740 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.56■■■□□ 2
F9P00740 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F9P00740 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
F9P00740 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.55■■■□□ 2
F9P00740 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
F9P00740 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
F9P00740 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F9P00740 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F9P00740 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
F9P00740 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F9P00740 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
F9P00740 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F9P00740 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F9P00740 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F9P00740 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F9P00740 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F9P00740 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F9P00740 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
F9P00740 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
F9P00740 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F9P00740 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
F9P00740 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F9P00740 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
F9P00740 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
F9P00740 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
F9P00740 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F9P00740 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F9P00740 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F9P00740 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
F9P00740 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F9P00740 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F9P00740 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
F9P00740 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F9P00740 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F9P00740 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
F9P00740 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
F9P00740 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F9P00740 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F9P00740 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
F9P00740 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F9P00740 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms