Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAK4O96013 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAK4O96013 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAK4O96013 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAK4O96013 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAK4O96013 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAK4O96013 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAK4O96013 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAK4O96013 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAK4O96013 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAK4O96013 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAK4O96013 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAK4O96013 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAK4O96013 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAK4O96013 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAK4O96013 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAK4O96013 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAK4O96013 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAK4O96013 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAK4O96013 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAK4O96013 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAK4O96013 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PAK4O96013 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAK4O96013 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAK4O96013 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAK4O96013 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAK4O96013 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAK4O96013 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAK4O96013 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAK4O96013 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAK4O96013 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAK4O96013 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAK4O96013 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAK4O96013 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAK4O96013 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PAK4O96013 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PAK4O96013 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAK4O96013 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PAK4O96013 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PAK4O96013 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAK4O96013 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAK4O96013 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAK4O96013 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAK4O96013 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAK4O96013 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAK4O96013 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAK4O96013 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAK4O96013 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAK4O96013 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAK4O96013 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAK4O96013 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAK4O96013 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PAK4O96013 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAK4O96013 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAK4O96013 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAK4O96013 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAK4O96013 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAK4O96013 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAK4O96013 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAK4O96013 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAK4O96013 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAK4O96013 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAK4O96013 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAK4O96013 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAK4O96013 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAK4O96013 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAK4O96013 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAK4O96013 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAK4O96013 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAK4O96013 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAK4O96013 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAK4O96013 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAK4O96013 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAK4O96013 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAK4O96013 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAK4O96013 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAK4O96013 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAK4O96013 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAK4O96013 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAK4O96013 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAK4O96013 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAK4O96013 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PAK4O96013 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PAK4O96013 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAK4O96013 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PAK4O96013 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms