Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTBP3O95758 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTBP3O95758 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTBP3O95758 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP3O95758 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTBP3O95758 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTBP3O95758 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms