Protein–RNA interactions for Protein: O95139

NDUFB6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB6O95139 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFB6O95139 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFB6O95139 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDUFB6O95139 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDUFB6O95139 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFB6O95139 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFB6O95139 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms